Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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