Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms