Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms