Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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