Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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