Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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