Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Amigo3Q8C2S7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Amigo3Q8C2S7 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Amigo3Q8C2S7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms