Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo38Q8BMI0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms