Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms