Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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