Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Msl2Q69ZF8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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