Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms