Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rbm27Q5SFM8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rbm27Q5SFM8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rbm27Q5SFM8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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