Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl5Q5DTT4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms