Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms