Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms