Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms