Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms