Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms