Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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