Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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