Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms