Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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