Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Taf1bP97358 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Taf1bP97358 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Taf1bP97358 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Taf1bP97358 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Taf1bP97358 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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