Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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