Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp4P59240 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms