Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms