Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms