Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VtnP29788 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VtnP29788 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
VtnP29788 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
VtnP29788 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VtnP29788 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms