Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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