Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms