Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifna9P09235 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms