Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Timm44O35857 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms