Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cited2O35740 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms