Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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