Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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