Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms