Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms