Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Efna3O08545 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Efna3O08545 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms