Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp35M0QWN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms