Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp17lcG5E8I7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms