Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms