Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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