Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21977F6U3N7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21977F6U3N7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms