Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms