Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3002E9PW72 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3002E9PW72 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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