Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Usf3B2RUQ2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms