Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Lcn6A2AJB9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Lcn6A2AJB9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lcn6A2AJB9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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