Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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