Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek3Q9R0A5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms